33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00477 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00477  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 173 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.185455  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00482  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  343  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.275959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0628  hypothetical protein  99.42 
 
 		 173 aa  342  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0247504  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3095  membrane-bound metal-dependent hydrolase  98.84 
 
 		 173 aa  339  9e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0342727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0447  hypothetical protein  97.69 
 
 		 173 aa  317  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000487062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0567  hypothetical protein  97.69 
 
 		 173 aa  317  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000105687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3086  membrane-bound metal-dependent hydrolase  97.69 
 
 		 173 aa  316  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0602  hypothetical protein  97.69 
 
 		 173 aa  316  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000045607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0572  hypothetical protein  95.95 
 
 		 173 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0154428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0588  inner membrane protein YbcI  85.8 
 
 		 181 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.337402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0593  inner membrane protein YbcI  85.8 
 
 		 181 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.0138038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0648  hypothetical protein  85.8 
 
 		 181 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0586  inner membrane protein YbcI  85.8 
 
 		 181 aa  278  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.150683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0585  inner membrane protein YbcI  85.21 
 
 		 181 aa  277  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0279815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1266  putative metal-dependent hydrolase, membrane-bound  72.67 
 
 		 182 aa  240  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3150  hypothetical protein  72.67 
 
 		 182 aa  240  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.552218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1380  membrane-bound metal-dependent hydrolase  72.67 
 
 		 182 aa  240  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  48.12 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  46.51 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65580  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  50 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04381  inner membrane protein YbcI  45.03 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4023  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.01 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  36.94 
 
 		 314 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.21 
 
 		 375 aa  47.4  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.21 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.5 
 
 		 375 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  29.73 
 
 		 333 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 		 354 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 		 359 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  28.45 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0477  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.65 
 
 		 342 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2634  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.06 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>