40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06039 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  66.06 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.81 
 
 		 356 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.11 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  33.53 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  32.65 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.1 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.68 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  27.81 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.29 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.1 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.82 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.14 
 
 		 375 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 357 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.13 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  27.48 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.67 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.55 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.87 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  32.49 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.72 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  26.75 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.64 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.51 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  35.78 
 
 		 162 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.05 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.13 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.97 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.05 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.28 
 
 		 358 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5691  inner membrane protein YbcI  34.69 
 
 		 179 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.06 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.05 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>