49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04870 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  682    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.55 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.23 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.92 
 
 
359 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  35.19 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
354 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.81 
 
 
375 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.25 
 
 
355 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.46 
 
 
351 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.92 
 
 
357 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.93 
 
 
342 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.23 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  31.09 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.45 
 
 
375 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  27.81 
 
 
333 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  27.39 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.06 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.42 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.01 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.09 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  37.41 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  37.41 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  44.16 
 
 
162 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.57 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  21.99 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04684  hypothetical protein  23.6 
 
 
203 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  24.41 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  25.49 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.56 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  24.41 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  24.41 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  24.41 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.13 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.08 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  24.71 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  30.97 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  24.71 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  24.02 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  30.97 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.35 
 
 
326 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0588  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.43 
 
 
193 aa  46.6  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  30.56 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.93 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>