39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1407 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  657    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  78.4 
 
 		 325 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  78.4 
 
 		 325 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.62 
 
 		 326 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  45.23 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.08 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  44.95 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  44.65 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  44.92 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  44.62 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  44.92 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  44.92 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  44.95 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  44.65 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  44.95 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  44.95 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  26.75 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.48 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.05 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  25.33 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.11 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.69 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  21.47 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.16 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.14 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.43 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.27 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  26.13 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2122  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1252 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.33 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.39 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  30.56 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0109  hypothetical protein  32 
 
 		 183 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.07 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  23.97 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>