92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1892 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1892  cytochrome c, class I  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.511028  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1022  cytochrome c-552 precursor  61.54 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1576  cytochrome c-551 precursor  57.41 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.233841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3735  cytochrome c-551 precursor  62.37 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  0.678372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  41.05 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  37.3 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  37.3 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  36.75 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  36 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  39.82 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  34.21 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  36.56 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  31.2 
 
 		 909 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  34.51 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  34.51 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  35.79 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  34.41 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  35.24 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  35.24 
 
 		 1151 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  30.63 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  29.37 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  32.58 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  32.26 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  31.52 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  29.82 
 
 		 908 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  31.58 
 
 		 1182 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  28 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  28 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  31.46 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  28 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 800 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  29.57 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  29.35 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  31.87 
 
 		 344 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  27.05 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  28.04 
 
 		 457 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 350 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  28.28 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 350 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4077  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  26.79 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  28.28 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5907  cytochrome c, class I  28.21 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0867069  normal  0.452961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  32.69 
 
 		 918 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  29.2 
 
 		 360 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  26.77 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  32.65 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  27.55 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1337  cytochrome c class I  34.92 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  27.96 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  33.68 
 
 		 984 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>