83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1022 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1022  cytochrome c-552 precursor  100 
 
 		 125 aa  256  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1892  cytochrome c, class I  61.54 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.511028  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3735  cytochrome c-551 precursor  68.82 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  0.678372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1576  cytochrome c-551 precursor  62.5 
 
 		 133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.233841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 348 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  31.4 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  33.03 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  30.58 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  32.8 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  31.93 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  34.02 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  33.61 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  34.75 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3583  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  33.7 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2906  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  31.93 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 1151 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  28.1 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  31.67 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  32.98 
 
 		 909 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  28.32 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 249 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 124 aa  43.5  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  41.07 
 
 		 1182 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  32.98 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  27.37 
 
 		 218 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 918 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1962  cytochrome c family protein  32.29 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  26.88 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 800 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  26.09 
 
 		 116 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  29.35 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  28.12 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  28.23 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4077  cytochrome c, class I  32.65 
 
 		 109 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 100 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  32.29 
 
 		 166 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  27.08 
 
 		 117 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  32.18 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 108 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 119 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  27.08 
 
 		 117 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 101 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  27.08 
 
 		 117 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5907  cytochrome c, class I  28.44 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0867069  normal  0.452961 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  28 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 344 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  30.97 
 
 		 908 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  26.88 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5197  putative cytochrome c  31.03 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00308424  normal  0.125409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  39.29 
 
 		 1143 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  31.58 
 
 		 984 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>