131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5907 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5907  cytochrome c, class I  100 
 
 
111 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0867069  normal  0.452961 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6193  cytochrome c, class I  83.78 
 
 
111 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.479437  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0457  cytochrome c family protein  63.3 
 
 
171 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6318  putative cytochrome c552  61.26 
 
 
111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1140  cytochrome c family protein  62.5 
 
 
114 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1842  putative cytochrome C552  63.46 
 
 
111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148193  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  36.04 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  38.32 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  39.51 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  37.76 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  37.76 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  37.76 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  36.73 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  37.04 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  39.02 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  42.68 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  37.04 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  35.8 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  40.24 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  36.54 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  40 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  38.27 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  41.25 
 
 
344 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  39.53 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  37.04 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  34.65 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  36.89 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  37.8 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  37.8 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  40 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  40.24 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  36.89 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  38.75 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  38.54 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  38.37 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  35.37 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  36.27 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1033  cytochrome c, class I  40.7 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.30031  normal  0.50008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  32 
 
 
115 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  36.14 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  36.27 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  36.27 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  36.27 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0126  cytochrome c class I  36.05 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  29.63 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  37.5 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  36.99 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  37.04 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  37.04 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  40.24 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  39.47 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  37.84 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  38.27 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  29.63 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  37.62 
 
 
984 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  38.27 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  37.5 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  33.7 
 
 
348 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  38.55 
 
 
360 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  41.46 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  32.71 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  34.57 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  37.5 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  36.89 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  38.75 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  37.04 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  37.5 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  36.61 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  38.16 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  32.98 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  34.57 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
800 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  36.71 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1962  cytochrome c family protein  39.51 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  38.27 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  36.25 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  36.25 
 
 
1138 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  30.34 
 
 
197 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  35.23 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  32.5 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  47.37 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  36.25 
 
 
941 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  32.67 
 
 
918 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  40.74 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  36.49 
 
 
909 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  31.33 
 
 
229 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>