39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1158 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  47.1 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  44.4 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  47.73 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  40.96 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  41.16 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  42.44 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  38.46 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  25.67 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  28.99 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  30.54 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  32.11 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  28.46 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  24.89 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  31.91 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  30.65 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  32.07 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  29.9 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  30.5 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  30.69 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  27.91 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  30.2 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  29.8 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  27.04 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  30.46 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  28.9 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  26.46 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  23.65 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  27.5 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  27.27 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  31.02 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  33.77 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  35.35 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  35.35 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  29.29 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  29.23 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  28.37 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  30.51 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>