26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0185 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  45.82 
 
 
257 aa  248  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  48.19 
 
 
248 aa  236  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  32.77 
 
 
251 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  29.34 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  29.63 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  29.09 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24.34 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  27.11 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  28.94 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  27.85 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  29.56 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  26.32 
 
 
279 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  25.58 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  25.4 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  27.19 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  23.23 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  25.78 
 
 
330 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  26.57 
 
 
300 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  29.65 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  23.9 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  25.2 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  28.82 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  24.23 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  29.36 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>