31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0781 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  28.89 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.22 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  28.52 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  30.05 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  29.52 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  28.69 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  25.49 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  27.27 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  32.2 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  27.47 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  27.72 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  25.46 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  30.5 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  25.66 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  24.32 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  26.28 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2014  hypothetical protein  28.72 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.765055  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  23.74 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  22.69 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  23.26 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  25.13 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  26.28 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  24.74 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  24.76 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  25.69 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  22.31 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  23.47 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  26.46 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  23.71 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  23.71 
 
 
249 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>