33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  47.83 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  44.53 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  44.53 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  47.18 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  44.76 
 
 		 321 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  39.33 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  33.06 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  42.07 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  30.62 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  32.63 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  29.84 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  29.29 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  32.24 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.87 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.86 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  30.74 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  32.51 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  25.28 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  28.12 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  30.69 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  24.89 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  25.62 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  28.8 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2014  hypothetical protein  24.4 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.765055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  26.6 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  26 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  23.47 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  20 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>