37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1810 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  30.43 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  28.38 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  27.02 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  28.75 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  29 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  28.99 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  27.43 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  25.7 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  27.73 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  27.11 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  27.74 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  25.88 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  35.14 
 
 
241 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.91 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  34.23 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  26.15 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  24.71 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  25.86 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  27.03 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  25.62 
 
 
300 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  23.23 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  23.19 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  24.79 
 
 
296 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  28.8 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  24.79 
 
 
286 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  24.64 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  20.72 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  28.7 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1294  protein of unknown function DUF364  22.03 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0478053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  23.53 
 
 
321 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  22.18 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  22.57 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  27.07 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>