37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1885 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  31.35 
 
 
302 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  30.43 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  25.88 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  28.21 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  26.94 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  24.02 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  25.2 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  24.44 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  26.45 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  24.8 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  23.66 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  22.87 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  23.92 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  23.38 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  24.9 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  25.95 
 
 
249 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  27.59 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  30.68 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  24.78 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  25.47 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  22.63 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  25.31 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  21.43 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  25.13 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  22.34 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  22.75 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  44.44 
 
 
249 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  25.3 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  42.55 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  23.92 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  26.22 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  26.22 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  29.81 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1294  protein of unknown function DUF364  21.34 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0478053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  20 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>