21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  524  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  51.81 
 
 
256 aa  279  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  44.19 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  39.09 
 
 
249 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  39.34 
 
 
281 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  39.62 
 
 
257 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  35.63 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  34.51 
 
 
330 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  30.65 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  35.32 
 
 
321 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  27.98 
 
 
249 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  27.98 
 
 
249 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  32.11 
 
 
249 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  32.41 
 
 
249 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  29.34 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  30.37 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  29.83 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  29.79 
 
 
279 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  27.06 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  28.8 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  29.81 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>