21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04820 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  533  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  51.81 
 
 
254 aa  279  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  51.03 
 
 
277 aa  246  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  38.68 
 
 
249 aa  165  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  38.17 
 
 
281 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  34.67 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  34.16 
 
 
251 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  31.37 
 
 
257 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  31.3 
 
 
330 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  28.57 
 
 
249 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  28.57 
 
 
249 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  31.37 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  29.41 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  30.89 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  30.3 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  30.77 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  32.12 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  35.53 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  28.4 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  25.1 
 
 
255 aa  45.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  32.28 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>