32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1182 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  677    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  48.3 
 
 		 321 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  44.98 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  45.38 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  44.23 
 
 		 257 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  47.18 
 
 		 249 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  37.18 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  31.3 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  33.59 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  35.32 
 
 		 277 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  34.51 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  33.63 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  31.3 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  32.4 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  32.6 
 
 		 245 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  27.95 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.65 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  27.23 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  29.08 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  29.08 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  25.81 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  25.64 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  22.35 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  27.43 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  27.16 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  25.36 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  24.62 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  26 
 
 		 279 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  24.64 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  26.32 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  23.68 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  27.5 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>