39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1476 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  61.89 
 
 
271 aa  304  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  51.61 
 
 
259 aa  241  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  36.55 
 
 
302 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  32.69 
 
 
257 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  30.99 
 
 
248 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  28.38 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  25.88 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  32.77 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  30.51 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.4 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  34.82 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  28.28 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  28.69 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  28.74 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  30.49 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  31.65 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  33.33 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  31.6 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  29.95 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  32.51 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  28.51 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  25.19 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  29.02 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  25.46 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  34.13 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  26.32 
 
 
296 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  27.43 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  41.84 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1294  protein of unknown function DUF364  23.81 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0478053  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  30.09 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  32.77 
 
 
251 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  26.78 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  26.78 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  29.32 
 
 
321 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  28.95 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  27.92 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>