17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1471 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  36.82 
 
 
300 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  32.1 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  32 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  32.06 
 
 
279 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  27.74 
 
 
277 aa  106  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.86 
 
 
275 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  29.14 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  29.52 
 
 
268 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  25.66 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  27.2 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  26.27 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  26.21 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  26.16 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  30.65 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  36.26 
 
 
258 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  23.83 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>