38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2364 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  564  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  56.41 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  52.19 
 
 
277 aa  276  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  50.55 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  50.18 
 
 
275 aa  265  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  46.38 
 
 
300 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  44.06 
 
 
282 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  42.44 
 
 
285 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  28.68 
 
 
302 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  32 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  30.51 
 
 
259 aa  92.8  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  28.28 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  27.53 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  28.69 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  24.44 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  30.24 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  25.6 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  25.38 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.79 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  30.32 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  30.35 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  26.74 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  26.74 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  24.9 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  25.97 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  30.85 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  28.94 
 
 
251 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  25.36 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  28.8 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  24.79 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  31.1 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  31.1 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  37.35 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  22.01 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  30.86 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1891  hypothetical protein  23.2 
 
 
227 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.908342 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  31.17 
 
 
246 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>