34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0019 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  55.65 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  45.82 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  32.69 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  29.39 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  28.63 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  28.09 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  27.2 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  24.44 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  24.7 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  27.12 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  25.7 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  25 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  22.87 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  25.1 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  27.39 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  23.95 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  27.91 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  24.02 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1891  hypothetical protein  23.29 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.908342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  24.62 
 
 		 330 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  23.74 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  26.5 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  29.21 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1294  protein of unknown function DUF364  21.15 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0478053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  24.75 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  24 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  24.29 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  26.64 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  25.52 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  26 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  23.36 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  23.97 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>