32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1692 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  53.51 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  50.18 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  46.38 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  44.16 
 
 		 275 aa  242  7e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  43.38 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  40.96 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  37.68 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  36.82 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  30.82 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  27.63 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  29.15 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  28.69 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  32.2 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  29.2 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.84 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  32.06 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  25.48 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  26.45 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  24.02 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  25.62 
 
 		 258 aa  52.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  32.06 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  22.69 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  26.32 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  30.67 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  31.52 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  26.57 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  24.6 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  24.6 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  32.09 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1818  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.258127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  42.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>