32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0338 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  55.65 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  48.19 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  30.99 
 
 
251 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  30.93 
 
 
259 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  31.23 
 
 
271 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  29.69 
 
 
302 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  29 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  25.49 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  27.57 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  25.38 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  24.79 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  22.66 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  29.35 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  58.5  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  25.62 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  26.52 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  24.78 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  24.29 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  24.29 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  25.43 
 
 
271 aa  55.1  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  22.81 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  24.62 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  26.51 
 
 
247 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  23.19 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  22.69 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  23.68 
 
 
330 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  28.21 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  23.23 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  23.27 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1294  protein of unknown function DUF364  21.19 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0478053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>