35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1975 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  52.03 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  51.61 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  34.8 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  32.81 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  30.93 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  28.63 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  30.31 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  30.51 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  27.02 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  27.76 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  29.34 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  28.21 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  29.15 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  32.2 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  30.42 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  29.41 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  24.41 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  25 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  31.67 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  27.2 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  29.88 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  27.16 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  26.95 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  26.88 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  23.26 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  25.42 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  23.36 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  26.6 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  30.63 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2014  hypothetical protein  29.73 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.765055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1891  hypothetical protein  21.76 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.908342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  29.07 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  24.44 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>