41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0338 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  502  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  63.75 
 
 
249 aa  328  4e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  38.89 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  35.1 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  32.41 
 
 
254 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  29.39 
 
 
321 aa  95.5  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  29.02 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  29.96 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  30.89 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  29.38 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  25.4 
 
 
257 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  29.87 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  29.65 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  35.59 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  30.21 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  35.71 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  22.54 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  22.54 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  28.99 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  33.18 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  27.12 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  31.6 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  30.46 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  29.79 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  26.2 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  29.84 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  31.91 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  29.88 
 
 
259 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2014  hypothetical protein  28.95 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.765055  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  26.52 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  26.67 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  27.7 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  28.77 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  22.34 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  24.74 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  26.7 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>