29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4260 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  100 
 
 
251 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  43.08 
 
 
249 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  42.57 
 
 
281 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1509  protein of unknown function DUF364  39.76 
 
 
257 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21160  hypothetical protein  35.63 
 
 
254 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1122  protein of unknown function DUF364  37.19 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.120711  hitchhiker  0.000000000790432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04820  hypothetical protein  34.16 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.62014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  29.34 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  29.75 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  32.4 
 
 
330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  28.74 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  29.96 
 
 
249 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  29.72 
 
 
321 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  34.68 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  35.59 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  30.81 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  32.61 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  27.54 
 
 
277 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  23.28 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  27.09 
 
 
271 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  42.55 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  30.63 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  28.81 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  32.58 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  28.18 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  33.7 
 
 
285 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>