39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1948 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  61.89 
 
 
251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  52.03 
 
 
259 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  39.67 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  31.23 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  29.39 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1810  hypothetical protein  28.75 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  28.16 
 
 
275 aa  89  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  28.52 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  32.44 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0185  hypothetical protein  27.46 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000524108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  32.32 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  27.53 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  26.94 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  33.18 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  28.46 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01550  hypothetical protein  30.74 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0299  hypothetical protein  29.63 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  23.98 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  32.74 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  25.48 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  27.4 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4584  hypothetical protein  25.91 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599227  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1425  hypothetical protein  29.05 
 
 
281 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000165083  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1182  hypothetical protein  25.81 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.244935  hitchhiker  0.00178356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1665  hypothetical protein  26.05 
 
 
249 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000345808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  26.21 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1424  protein of unknown function DUF364  26.82 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1390  protein of unknown function DUF364  26.82 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  25.12 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  22.69 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2834  hypothetical protein  24.49 
 
 
321 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  25.13 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2224  protein of unknown function DUF364  26.47 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0290288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4260  protein of unknown function DUF364  31.91 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000106459  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1294  protein of unknown function DUF364  23.69 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0478053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>