26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2005 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2005  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0031  hypothetical protein  45.76 
 
 
279 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2364  hypothetical protein  44.06 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0231  protein of unknown function DUF364  41.76 
 
 
277 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1420  hypothetical protein  42.22 
 
 
289 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691077  normal  0.507757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1692  hypothetical protein  37.68 
 
 
300 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000206804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1453  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  39.41 
 
 
275 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000100261  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1158  hypothetical protein  37.68 
 
 
285 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1471  hypothetical protein  29.14 
 
 
296 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1303  hypothetical protein  28.24 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1948  hypothetical protein  27.45 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1975  hypothetical protein  25.32 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1476  hypothetical protein  28.88 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0781  hypothetical protein  27.27 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.95598  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0217  hypothetical protein  27.81 
 
 
241 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.12745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0019  hypothetical protein  23.69 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0735022  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0338  hypothetical protein  26.32 
 
 
249 aa  55.8  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0443757  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1471  hypothetical protein  27.35 
 
 
258 aa  55.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0387  hypothetical protein  28.4 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1281  hypothetical protein  26.58 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2702  protein of unknown function DUF364  29.03 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0338  protein of unknown function DUF364  22.4 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.296814  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1885  hypothetical protein  21.78 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1428  hypothetical protein  24.75 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000058801  normal  0.0273139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4779  hypothetical protein  24.65 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1323  hypothetical protein  21.99 
 
 
249 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0125945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>