More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2475 on replicon NC_007968
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007968  Pcryo_2475  CinA-like  100 
 
 
162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0362  CinA domain protein  43.95 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  0.424027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1723  CinA domain protein  40.54 
 
 
170 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0236925  hitchhiker  0.000170556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4162  CinA domain-containing protein  41.33 
 
 
157 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.413658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  27.85 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  33.62 
 
 
434 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  31.65 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 
421 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 
421 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  37.93 
 
 
382 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  30.97 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  34.88 
 
 
422 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  30.51 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  29.71 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  30 
 
 
413 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.4 
 
 
415 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  30 
 
 
418 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  32.61 
 
 
400 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  32.77 
 
 
418 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  28.35 
 
 
420 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  29.91 
 
 
413 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  34.82 
 
 
447 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  35.59 
 
 
422 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.06 
 
 
408 aa  62  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  30.43 
 
 
420 aa  62  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
401 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  32.58 
 
 
275 aa  61.6  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  32.38 
 
 
419 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  27.33 
 
 
413 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.06 
 
 
408 aa  61.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  24.52 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  31.86 
 
 
173 aa  60.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  30.63 
 
 
415 aa  60.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.91 
 
 
429 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  34.31 
 
 
408 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  29.03 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  31.82 
 
 
421 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  31.4 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  29.91 
 
 
413 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  29.91 
 
 
416 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  29.82 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  31.73 
 
 
419 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.82 
 
 
431 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  29.57 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  29.84 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  28.1 
 
 
415 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 
414 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  32.23 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  27.83 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  30.17 
 
 
424 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  30.17 
 
 
412 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  30.17 
 
 
412 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  31.62 
 
 
362 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  27.33 
 
 
413 aa  58.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  26.4 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  29.31 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  29.17 
 
 
412 aa  58.2  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  29.46 
 
 
430 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  29.17 
 
 
412 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  26.61 
 
 
436 aa  58.2  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  25.55 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  30.43 
 
 
412 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  30.43 
 
 
412 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  30.58 
 
 
166 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3132  competence damage-inducible protein A  25.97 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  32.8 
 
 
430 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  29.73 
 
 
427 aa  57.4  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  30.36 
 
 
437 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  24.65 
 
 
412 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  33.33 
 
 
426 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.46 
 
 
430 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 
414 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  27.68 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  31.09 
 
 
425 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  31.09 
 
 
425 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  29.09 
 
 
417 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  30.4 
 
 
438 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  29.85 
 
 
423 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  28.37 
 
 
420 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  30.56 
 
 
432 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  28.45 
 
 
412 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0552  hypothetical protein  29.86 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  28.77 
 
 
408 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  33.03 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  29.31 
 
 
412 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  26.95 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  29.23 
 
 
203 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  29.66 
 
 
417 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  27.59 
 
 
412 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  27.13 
 
 
418 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  30.17 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  25.17 
 
 
403 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  29.31 
 
 
425 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  29.27 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  33.63 
 
 
413 aa  55.1  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  27.87 
 
 
412 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  26.9 
 
 
211 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.33 
 
 
429 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  27.59 
 
 
208 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>