More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1723 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1723  CinA domain protein  100 
 
 		 170 aa  350  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0236925  hitchhiker  0.000170556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0362  CinA domain protein  56.38 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  0.424027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4162  CinA domain-containing protein  43.88 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.413658  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2475  CinA-like  40.54 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  32.67 
 
 		 400 aa  89.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 413 aa  89.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  33.99 
 
 		 408 aa  88.6  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 408 aa  87.8  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  35.29 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  33.56 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  30.57 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  32.37 
 
 		 403 aa  78.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 414 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36 
 
 		 420 aa  78.2  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  32 
 
 		 417 aa  78.2  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  32.56 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  34.67 
 
 		 382 aa  77.4  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  29.82 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.7 
 
 		 411 aa  75.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  32.68 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 		 429 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  31.58 
 
 		 413 aa  75.1  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  30.37 
 
 		 408 aa  74.7  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  31.88 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  32.43 
 
 		 415 aa  73.9  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  31.45 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  31.11 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  27.92 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  31.11 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  28.38 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  30 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  28.86 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  32.45 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  31.33 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 414 aa  72  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  30.91 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  35 
 
 		 416 aa  71.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 371 aa  71.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  32.14 
 
 		 415 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  32.73 
 
 		 423 aa  70.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  32.35 
 
 		 275 aa  70.9  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  32.21 
 
 		 412 aa  70.5  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  34.23 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.14 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  35.64 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  30.19 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.84 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  27.27 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  29.41 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  35.04 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 401 aa  68.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  35.25 
 
 		 418 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 416 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  33.61 
 
 		 420 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  37.38 
 
 		 414 aa  68.2  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  29.94 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  27.92 
 
 		 423 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  31.93 
 
 		 416 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  28.77 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  34.55 
 
 		 423 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  28.05 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  35.51 
 
 		 425 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  35.64 
 
 		 432 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  29.82 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  31.88 
 
 		 413 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  34.86 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0279  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.8 
 
 		 365 aa  67  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  34.17 
 
 		 437 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  31.79 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  27.46 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  34.86 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  29.05 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  31.82 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  34.38 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.19 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  34.86 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  32.23 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  33.61 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  27.56 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  29.68 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  28.05 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  29.05 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  29.05 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  29.25 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  30.5 
 
 		 422 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  33.96 
 
 		 430 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  30.07 
 
 		 418 aa  64.3  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  32.17 
 
 		 364 aa  64.3  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  27.92 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.64 
 
 		 424 aa  63.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  34.86 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  32.35 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  29.03 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  29.03 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  27.92 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  28.21 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  35.71 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  29.03 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  31.67 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>