More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0279 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0279  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 365 aa  739    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  69.59 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  52.34 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1205  competence/damage-inducible domain-containing protein  43.53 
 
 		 362 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1081  competence/damage-inducible domain-containing protein  43.8 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0661  competence/damage-inducible domain-containing protein  43.8 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1162  competence/damage-inducible protein, CinA family  45.3 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  43.68 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  42.58 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  34.34 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  48.94 
 
 		 166 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  45.7 
 
 		 218 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  46.41 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  49.33 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  48.15 
 
 		 159 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  47.26 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  43.14 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  45.21 
 
 		 184 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  40.85 
 
 		 166 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  45.21 
 
 		 162 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  45.21 
 
 		 162 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  40.24 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  44.81 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  40.24 
 
 		 166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  42.38 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  40.24 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  42.38 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  44.37 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  40.24 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  42.38 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  40.24 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  40.24 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3720  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.406121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  41.77 
 
 		 172 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  45.32 
 
 		 162 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  43.15 
 
 		 164 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  36.19 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.32 
 
 		 156 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  40.13 
 
 		 163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  46.76 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0186  competence/damage-inducible protein CinA  43.54 
 
 		 424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  43.92 
 
 		 166 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  43.97 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  44.23 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  41.38 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  43.06 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  37.85 
 
 		 411 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 412 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  43.26 
 
 		 160 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  44.6 
 
 		 162 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  42.36 
 
 		 165 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  44.78 
 
 		 160 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 424 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  39.74 
 
 		 203 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3382  competence-damaged protein CinA  38.51 
 
 		 165 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000695427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  44.22 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  42.55 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  42.95 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  42.95 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  41.83 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  40.74 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  42.38 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0223  competence/damage-inducible protein CinA  43.51 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0622  CinA-like protein  41.07 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.550403  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  42.95 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  42.57 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  40.4 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  43.45 
 
 		 166 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.69 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  37.72 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  45.32 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.88 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  44.6 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  42.28 
 
 		 165 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.5 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  42 
 
 		 168 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 165 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  44.6 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  39.61 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  38.31 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  44.6 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>