37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1582 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  100 
 
 
145 aa  291  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  57.78 
 
 
156 aa  160  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  57.46 
 
 
157 aa  156  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  57.46 
 
 
155 aa  146  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  53.28 
 
 
155 aa  140  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  51.47 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  57.72 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  49.26 
 
 
160 aa  136  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  49.15 
 
 
136 aa  120  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  50 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  42.42 
 
 
185 aa  90.9  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  42.74 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  56.52 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  38.79 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2043  paREP8  43.02 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  36.55 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  41.77 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1700  PaREP8 domain-containing protein  34.51 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00498929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  32.37 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  33.83 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  33.6 
 
 
167 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  34.19 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  32.5 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0526  PaREP1 domain-containing protein  29.2 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0265623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  27.82 
 
 
163 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  40.7 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  31.71 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  39.74 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0697  PaREP1 domain-containing protein  28.69 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0975506  normal  0.271276 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  40 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  37.93 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  33.73 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  34.07 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0497  PaREP1 domain-containing protein  31.58 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.788078  hitchhiker  0.0000136019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2032  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.48 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000149502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0769  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.73 
 
 
320 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  35.29 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>