19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0878 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  74.24 
 
 
157 aa  107  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  74.24 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  72.31 
 
 
155 aa  100  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  71.21 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  69.23 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  68.18 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  56.52 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  64.41 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  61.02 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  59.09 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  43.75 
 
 
199 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  45.76 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  37.04 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  37.04 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  41.27 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  36.9 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0526  PaREP1 domain-containing protein  31.43 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0265623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  36.21 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>