30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0290 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  100 
 
 
155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  65.57 
 
 
136 aa  169  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  59.42 
 
 
163 aa  160  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  59.71 
 
 
156 aa  158  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  59.12 
 
 
157 aa  155  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  59.12 
 
 
155 aa  152  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  53.96 
 
 
160 aa  149  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  60.94 
 
 
155 aa  146  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  53.28 
 
 
145 aa  140  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2043  paREP8  57.61 
 
 
99 aa  103  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  55.86 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  64.41 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  38.81 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  36.08 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  37.06 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  33.57 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  35.48 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  45.59 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  48.15 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  30.13 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  41.11 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0526  PaREP1 domain-containing protein  25.32 
 
 
161 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0265623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1700  PaREP8 domain-containing protein  29.76 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00498929  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  33.83 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  29.55 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  31.08 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  38.16 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0697  PaREP1 domain-containing protein  29.49 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0975506  normal  0.271276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  37.33 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  34.62 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>