24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1505 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  312  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  60.67 
 
 
176 aa  173  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  59.62 
 
 
162 aa  170  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  58.39 
 
 
158 aa  155  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  65.18 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  54.89 
 
 
151 aa  124  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  45.21 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  45.22 
 
 
164 aa  107  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  47.06 
 
 
167 aa  102  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  44.22 
 
 
173 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  47.01 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  45.39 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  40.28 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  47.76 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  39.22 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  38.46 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  35.06 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  43.4 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  33.83 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  34.53 
 
 
185 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  32.64 
 
 
152 aa  47.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  38.74 
 
 
120 aa  47.4  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.56 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  32.12 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>