22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1549 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  100 
 
 
158 aa  314  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  62 
 
 
176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  64.97 
 
 
162 aa  186  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  58.39 
 
 
164 aa  152  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  61.54 
 
 
123 aa  148  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  48.7 
 
 
151 aa  141  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  49.37 
 
 
185 aa  123  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  41.61 
 
 
167 aa  117  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  41.14 
 
 
164 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  40.74 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  40.62 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  37.58 
 
 
169 aa  100  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  45.19 
 
 
161 aa  100  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  40.88 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  36.91 
 
 
166 aa  94  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  34.87 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  40.65 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  40.91 
 
 
121 aa  77  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  31.82 
 
 
120 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  30.63 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  29.25 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  33.86 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>