22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1696 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  322  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  64.6 
 
 
171 aa  209  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  55.15 
 
 
173 aa  186  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  59.63 
 
 
167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  43.21 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  43.21 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  43.75 
 
 
157 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  41.06 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  41.09 
 
 
156 aa  104  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  40.49 
 
 
185 aa  101  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  43.62 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  37.5 
 
 
176 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  34.87 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  33.96 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  38.73 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  40.28 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  40.24 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  35.78 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  45.71 
 
 
120 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  37.93 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  37.33 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  34.27 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>