20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1234 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  100 
 
 
162 aa  323  8.000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  64.97 
 
 
158 aa  186  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  57.33 
 
 
176 aa  168  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  59.62 
 
 
164 aa  167  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  58.12 
 
 
123 aa  130  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  46.15 
 
 
185 aa  121  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  47.18 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  43.75 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  43.23 
 
 
173 aa  110  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  42.41 
 
 
164 aa  110  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  38.41 
 
 
161 aa  97.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  33.96 
 
 
162 aa  92  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  39.35 
 
 
171 aa  90.9  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  37.5 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  39.46 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  37.5 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  37.4 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  40 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  38.36 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  35.71 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>