34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0388 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  56.58 
 
 
161 aa  175  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  55.1 
 
 
156 aa  155  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  48.99 
 
 
169 aa  141  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  46.85 
 
 
167 aa  130  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  47.65 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  45 
 
 
171 aa  121  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  45.71 
 
 
173 aa  121  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  43.75 
 
 
162 aa  115  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  37.91 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  38.56 
 
 
185 aa  87.8  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  36.91 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  40.88 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  40.58 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  35.29 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  35.06 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  33.61 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2727  PaREP1 family protein  52.83 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0252533  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  43.21 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  45 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  30.26 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  28.29 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  41.33 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1700  PaREP8 domain-containing protein  29.41 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00498929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  29.5 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0697  PaREP1 domain-containing protein  28.57 
 
 
157 aa  52  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0975506  normal  0.271276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  37.65 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  40 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  37.21 
 
 
155 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  45.1 
 
 
151 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  33.78 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  34.88 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  38.67 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  34.62 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>