28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0972 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  100 
 
 
171 aa  337  5.9999999999999996e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  64.6 
 
 
162 aa  209  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  60.69 
 
 
173 aa  204  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  63.69 
 
 
167 aa  204  6e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  45 
 
 
157 aa  121  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  46.9 
 
 
169 aa  120  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  45.12 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  45.4 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  45.93 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  44.44 
 
 
176 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  43.02 
 
 
185 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  47.24 
 
 
164 aa  103  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  40.62 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  40.52 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  45.39 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  37.89 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  44.83 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  35.24 
 
 
121 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  41.11 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  40.7 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  45.71 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  51.92 
 
 
163 aa  44.3  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  46.97 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  31.82 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  46.43 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  39.74 
 
 
156 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1700  PaREP8 domain-containing protein  43.42 
 
 
163 aa  42  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00498929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  33.77 
 
 
163 aa  40.8  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>