20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2222 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  291  3e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  56.21 
 
 
176 aa  152  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  48.7 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  54.17 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  54.89 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  45.77 
 
 
185 aa  104  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  44.83 
 
 
164 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  47.18 
 
 
162 aa  101  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  43.42 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  41.96 
 
 
161 aa  89.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  37.91 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  40.52 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  39.84 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  40.58 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  37.42 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  38.73 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  38 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  42.72 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  49.25 
 
 
120 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  35.29 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>