16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1766 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  48.21 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  36.7 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  45 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  45.71 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  41.44 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  42.31 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  45.71 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  44.78 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  49.25 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  44.3 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  40.26 
 
 		 185 aa  51.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  45.71 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  47.46 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  36.7 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  40 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>