20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2830 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  100 
 
 
121 aa  239  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  48.21 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  37.7 
 
 
185 aa  83.6  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  45.19 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  42.2 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  43.43 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  38.05 
 
 
167 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  39.64 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  38.74 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  42.39 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  37.84 
 
 
173 aa  67  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  42.61 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  37.39 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  41.12 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  43.96 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  36.52 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  39.17 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  43.97 
 
 
164 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  37.3 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  31.82 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>