23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0874 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2035  PaREP1 domain-containing protein  87.29 
 
 
123 aa  204  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1549  PaREP1 protein  62 
 
 
158 aa  176  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.660138  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1505  PaREP1 domain-containing protein  60.67 
 
 
164 aa  156  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000126877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2222  PaREP1 domain-containing protein  56.21 
 
 
151 aa  152  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.375329  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1234  PaREP1 protein  57.33 
 
 
162 aa  149  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.241641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  46.2 
 
 
185 aa  130  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  45.91 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  47.1 
 
 
167 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  44.44 
 
 
171 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  43.48 
 
 
161 aa  105  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  46.85 
 
 
173 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  40.26 
 
 
169 aa  98.2  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  41.94 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  41.27 
 
 
156 aa  94  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1696  PaREP8 domain-containing protein  37.5 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000587591  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  36.91 
 
 
157 aa  84.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2830  PaREP1 family protein  45.19 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1766  PaREP1 domain-containing protein  41.44 
 
 
120 aa  55.1  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  31.9 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  29.55 
 
 
155 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  31.9 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  27.98 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>