27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1501 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0697  PaREP1 domain-containing protein  55.84 
 
 
157 aa  147  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0975506  normal  0.271276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  52.74 
 
 
163 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1700  PaREP8 domain-containing protein  47.2 
 
 
163 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00498929  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  48.41 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2032  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  53.78 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000149502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  35.48 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  34.72 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  36.36 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  36.59 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1370  PaREP8 domain-containing protein  35.09 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.649394  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  36.55 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  36.88 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.37 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  36.15 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  33.85 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  31.25 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  31.75 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  28.29 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1629  PaREP1 domain-containing protein  31.95 
 
 
164 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0453048  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  33.82 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1440  PaREP1 protein  25.9 
 
 
185 aa  47.4  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000103722  hitchhiker  0.00000627215 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0874  PaREP1 domain-containing protein  27.98 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  35.62 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  31.82 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  31.2 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.48 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>