17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1309 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  36.08 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  40.4 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  36.55 
 
 
145 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  37.75 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  41.48 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  33.81 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  34.53 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  37.72 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  33.09 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  35.88 
 
 
152 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  35.88 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  33.85 
 
 
136 aa  58.2  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  33.82 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  41.27 
 
 
100 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  39.44 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  34.62 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>