22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2188 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  309  9e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  44.55 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  51.47 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  48.57 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  50 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  41.77 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  45.59 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  38.2 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  46.67 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  45.76 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  35.29 
 
 
199 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  44.62 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  45.1 
 
 
157 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  46 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  39.44 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  32.63 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  34.72 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  42.11 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  45.1 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  35.62 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  44.12 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>