17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1182 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  249  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  68.38 
 
 
156 aa  157  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  68.38 
 
 
157 aa  156  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  63.25 
 
 
155 aa  152  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  62.39 
 
 
155 aa  149  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  56.03 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  53.39 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  55.86 
 
 
155 aa  114  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  51.96 
 
 
136 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  50.86 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  59.09 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  38.98 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2043  paREP8  50.7 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  44.12 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  37.61 
 
 
162 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>