13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2043 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2043  paREP8  100 
 
 
99 aa  204  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  56.18 
 
 
163 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  57.61 
 
 
155 aa  103  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  58.62 
 
 
156 aa  100  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  52.75 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  54.02 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  50.57 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  44.19 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  52.05 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  43.02 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  50.7 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  35.56 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  37.11 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>