20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0289 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  100 
 
 
136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  65.57 
 
 
155 aa  169  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  58.33 
 
 
157 aa  147  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  58.2 
 
 
156 aa  144  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  54.47 
 
 
160 aa  143  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  57.14 
 
 
163 aa  143  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  57.63 
 
 
155 aa  139  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  61.47 
 
 
155 aa  137  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  49.15 
 
 
145 aa  120  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  51.96 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2043  paREP8  50.57 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  40.52 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  37.3 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  61.02 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  33.85 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  38.2 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0526  PaREP1 domain-containing protein  25.62 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0265623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  32.48 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  28.43 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>