11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0526 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0526  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  328  3e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0265623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  30.3 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  33.86 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  30.53 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  26.52 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  34.19 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  28.46 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  25.32 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  29.2 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  25.62 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  31.43 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>